Doktorand prijavi temo oz. dispozicijo za doktorsko disertacijo proti koncu 1. letnika. Postopek prijave teme je podrobneje opisan v pravilniku o diplomiranju: doktorat znanosti in obsega obravnavo na komisiji za znanstvenoraziskovalno delo, Senatu UP FM in Senatu UP. Senat UP FM po predhodni obravnavi na Komisiji za znanstvenoraziskovalno delo UP FM obravnava temo in se do nje opredeli ter imenuje mentorja. Soglasje k predlogu teme in k dispoziciji daje senat univerze po predhodni obravnavi na univerzitetni komisiji za znanstvenoraziskovalno delo. Predstavitev teme doktorske disertacije je javna. Doktorand mora zagovarjati doktorsko disertacijo najpozneje v štirih letih od odobritve teme disertacije na senatu univerze.